Ombudsmandens virksomhed omfatter ikke domstolene, jf. § 7, stk. 2, i lov om Folketingets Ombudsmand (lovbekendtgørelse nr. 349 af 22. marts 2013).
Som en følgevirkning af ombudsmandens manglende kompetence over for domstolene afviser ombudsmanden normalt sager, der må forventes at blive pådømt af domstolene, fordi sagen er indbragt for domstolene. Afvisning sker også, hvis et væsentligt retligt problem i en sag må forventes at blive afgjort af domstolene i en anden sag end den, der er forelagt for ombudsmanden.
Der henvises til Lisbeth Adserballe mfl., Ombudsmandsloven med kommentarer, 2. udgave (2013), s. 78.